バイオ/創薬領域向け GPUサーバ
大規模なタンパク質構造予測およびゲノム変異解析に
タンパク質構造予測やゲノム変異解析に利用する計算サーバでは、CPU/GPU/メモリ容量の構成組合せが複雑です。NEC社評価結果を基に、推奨構成を提供します。
協力：日本電気株式会社（NEC）
AlphaFold2/GATK 実行向けの推奨構成を提供
タンパク質構造予測のAlphaFold2*¹、ゲノム変異解析のGATK*²を、GPUで実行できるNEC社推奨構成*³を提供します。
*１）AlphaFold2は2020年開催のCASP14で1位を獲得したタンパク質構造生成のソフトウェア
*２）GATKはゲノム変異解析において業界で標準的なソフトウェア
*３）推奨構成は以下参照
タンパク質構造用構成 価格は問合せください
| 品名 | 数量 | 概要・仕様 |
|---|---|---|
| Express5800/T120h 24x 2.5型モデル | 1 | 標準LAN(4x 1000BASE-T) |
| CPUボード (10 C/2.40GHz/Silver 4210R) | 2 | インテル(R) Xeon(R) プロセッサ Silver 4210R, 2Socket 計 20 コア /40 スレッド , 2.40GHz, TDP100W |
| 16GB増設メモリボード (1 x16GB/R/SR) | 4 | 1x 16GB Registered DIMM, Single Rank, DDR4-2933 (PC4-2933), ECC 付き |
| RAIDコントローラ (2GB RAID 0/1/5/6) | 1 | 内蔵SAS/SATA ドライブ用 PCI Express 3.0(x8), AROC, Standard HS, 8 Port(4 x 2 コネクタ ), 2 GB キャッシュ , RAID 0/1/5/6, 12Gbs |
| GPUコンピューティングカード (Tesla T4) | 1 | NVIDIA Tesla T4 |
| 増設用7.68 TB SSD | 2 | 1x 7.68 TB SAS SSD, 2.5型 , SAS-4, ホットスワップ対応 Read Intensive |
| 内蔵DVD ROM ドライブ | 1 | 9.5mm SATA DVD-ROM, 黒ベゼル |
| 電源ユニット(800 W/Platinum) | 2 | ホットプラグ対応, 80 PLUS Platinum 認定取得 |
| ExpressSupportPack G4 T120x(SSD搭載)用 5日間 8:30～17:30 対応(3 年間) |
1 | オンサイト保守サービス製品(定期保守なし) 対象:サーバ本体、およびサーバ内蔵オプション、週5日間 8:30～17:30 対応 (3 年間) |
| Linuxサービスセット Red Hat Enterprise Linux (v.8)(3 年) | 1 | Red Hat Enterprise Linux 8, CPUx2ソケット用,【3年間保守つき/平日8:30-17:30】 |
ゲノム変異解析用構成 価格は問合せください
| 品名 | 数量 | 概要・仕様 |
|---|---|---|
| Express5800/T120h 24x 2.5型モデル | 1 | 標準LAN(4x 1000BASE-T) |
| CPUボード (10 C/2.40GHz/Silver 4210R) | 2 | インテル(R) Xeon(R) プロセッサ Silver 4210R, 2Socket 計 20 コア /40 スレッド , 2.40GHz, TDP100W |
| 32GB増設メモリボード (1x32GB/R/DR) | 4 | 1x 32GB Registered DIMM, Dual Rank, DDR4-2933 (PC4-2933), ECC付き |
| RAIDコントローラ(2GB，RAID 0/1/5/6) | 1 | 内蔵 SAS/SATAドライブ用, PCI Express 3.0(x8), AROC, Standard HS, 8 Port(4 x 2コネクタ), 2GBキャッシュ, RAID 0/1/5/6, 12Gbs |
| GPUコンピューティングカード(Tesla T4) | 2 | NVIDIA Tesla T4 |
| 増設用7.68TB SSD | 2 | 1x 7.68 TB SAS SSD, SAS-4, 2.5型, ホットスワップ対応 Read Intensive |
| 内蔵DVD ROM ドライブ | 1 | 9.5mm SATA DVD-ROM, 黒ベゼル |
| 電源ユニット(1600W) | 2 | ホットプラグ対応, 80 PLUS Platinum認定取得 - 本製品はAC200V接続のみ使用可能。 |
| ExpressSupportPack G4 T120x(SSD搭載)用 5日間 8:30～17:30 対応(3 年間) |
1 | オンサイト保守サービス製品(定期保守なし) 対象:サーバ本体、およびサーバ内蔵オプション、週5日間 8:30～17:30 対応 (3 年間) |
| Linuxサービスセット Red Hat Enterprise Linux (v.8)(3 年) | 1 | Red Hat Enterprise Linux 8, CPUx2ソケット サーバ用,【3年間保守つき/平日8:30-17:30】 |
LinuxおよびAlphaFold2/GATKのインストール作業は含まれておりません。
エルエイシステムズでのインストール、保守・サポートも承りますので、お問い合わせください。
*４）実行時間は、お客様データに依存します
計算サーバ購入前に 生成されるタンパク質構造を確認
タンパク質構造予測 評価サービス（提供開始予定/問合せ受付中）
・お客様の1次データ（FASTA）から、AlphaFold2により、3次構造を5つ予測し、その画像を提示します。
・3次構造がお客様の期待通りの場合に、PDBデータを提供します。
・お客様が指定する部位のAlphaFold2信頼度を、3カ所提示します。
製品の詳細、価格等につきましてはお問い合わせまでご連絡下さい。
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